下属事业单位由原三个单位变更为两个。其单位职责分别为：

湖州市公共投资项目审计中心（预概算审查中心）

（一）协助市公共投资项目预算执行、竣工决算审计和市重大公共投资项目跟踪审计。
       （二）协助市援建资金、项目审计和重大灾后重建的跟踪审计工作。
       （三）负责审查政府性投资项目可行性研究报告，审核投资估算、初步设计和项目概算。

（四）负责审查市级财政部门提出的预算编制文件、相关定额标准。
       （五）负责审查市级部门、事业单位年度收支预算。
       （六）负责组织社会审计中介机构参与国家审计，对相关从业人员进行业务培训。
       （七）完成湖州市审计局交办的其他任务。

湖州市电子数据审计中心

主要职责是：

（一）负责审计业务电子数据的归口管理。

（二）负责全市审计数据库建设和运行维护管理工作，承担审计业务电子数据的采集、整理和汇集工作。

（三）承担数字化审计技术支撑，协助审计机关开展电子数据分析工作。

（四）参与对市级部门和国有企事业单位电子政务工程和信息化项目及信息系统的审计工作。

（五）参与专项审计调查。

（六）指导区县电子数据审计业务工作。

（七）完成湖州市审计局交办的其他任务。